Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
EGR3Q06889 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms