Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAD51Q06609 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAD51Q06609 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAD51Q06609 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAD51Q06609 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAD51Q06609 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAD51Q06609 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAD51Q06609 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAD51Q06609 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAD51Q06609 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAD51Q06609 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAD51Q06609 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAD51Q06609 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
RAD51Q06609 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAD51Q06609 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAD51Q06609 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAD51Q06609 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAD51Q06609 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAD51Q06609 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
RAD51Q06609 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAD51Q06609 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAD51Q06609 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAD51Q06609 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
RAD51Q06609 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAD51Q06609 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
RAD51Q06609 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
RAD51Q06609 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAD51Q06609 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAD51Q06609 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAD51Q06609 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAD51Q06609 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAD51Q06609 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAD51Q06609 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAD51Q06609 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms