Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNG1Q06432 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms