Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EXOSC9Q06265 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EXOSC9Q06265 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
EXOSC9Q06265 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EXOSC9Q06265 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EXOSC9Q06265 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EXOSC9Q06265 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EXOSC9Q06265 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EXOSC9Q06265 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EXOSC9Q06265 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EXOSC9Q06265 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EXOSC9Q06265 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EXOSC9Q06265 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
EXOSC9Q06265 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EXOSC9Q06265 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
EXOSC9Q06265 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EXOSC9Q06265 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EXOSC9Q06265 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EXOSC9Q06265 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EXOSC9Q06265 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EXOSC9Q06265 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EXOSC9Q06265 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EXOSC9Q06265 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EXOSC9Q06265 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EXOSC9Q06265 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EXOSC9Q06265 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
EXOSC9Q06265 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
EXOSC9Q06265 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EXOSC9Q06265 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EXOSC9Q06265 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
EXOSC9Q06265 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
EXOSC9Q06265 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
EXOSC9Q06265 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC24■■□□□ 1.43
EXOSC9Q06265 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC24■■□□□ 1.43
EXOSC9Q06265 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EXOSC9Q06265 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
EXOSC9Q06265 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
EXOSC9Q06265 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EXOSC9Q06265 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
EXOSC9Q06265 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
EXOSC9Q06265 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC24■■□□□ 1.43
EXOSC9Q06265 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
EXOSC9Q06265 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EXOSC9Q06265 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
EXOSC9Q06265 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EXOSC9Q06265 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EXOSC9Q06265 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC24■■□□□ 1.43
EXOSC9Q06265 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EXOSC9Q06265 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EXOSC9Q06265 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EXOSC9Q06265 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EXOSC9Q06265 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EXOSC9Q06265 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EXOSC9Q06265 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EXOSC9Q06265 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EXOSC9Q06265 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EXOSC9Q06265 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EXOSC9Q06265 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EXOSC9Q06265 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EXOSC9Q06265 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EXOSC9Q06265 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EXOSC9Q06265 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
EXOSC9Q06265 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
EXOSC9Q06265 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EXOSC9Q06265 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EXOSC9Q06265 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EXOSC9Q06265 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EXOSC9Q06265 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EXOSC9Q06265 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EXOSC9Q06265 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EXOSC9Q06265 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EXOSC9Q06265 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EXOSC9Q06265 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EXOSC9Q06265 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EXOSC9Q06265 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
EXOSC9Q06265 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EXOSC9Q06265 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EXOSC9Q06265 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EXOSC9Q06265 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EXOSC9Q06265 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EXOSC9Q06265 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EXOSC9Q06265 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EXOSC9Q06265 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EXOSC9Q06265 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EXOSC9Q06265 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EXOSC9Q06265 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EXOSC9Q06265 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms