Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CTDSPL2Q05D32 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTDSPL2Q05D32 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTDSPL2Q05D32 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTDSPL2Q05D32 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTDSPL2Q05D32 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTDSPL2Q05D32 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTDSPL2Q05D32 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTDSPL2Q05D32 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CTDSPL2Q05D32 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTDSPL2Q05D32 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTDSPL2Q05D32 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTDSPL2Q05D32 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTDSPL2Q05D32 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTDSPL2Q05D32 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTDSPL2Q05D32 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTDSPL2Q05D32 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTDSPL2Q05D32 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTDSPL2Q05D32 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CTDSPL2Q05D32 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTDSPL2Q05D32 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTDSPL2Q05D32 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTDSPL2Q05D32 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CTDSPL2Q05D32 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTDSPL2Q05D32 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTDSPL2Q05D32 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CTDSPL2Q05D32 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CTDSPL2Q05D32 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CTDSPL2Q05D32 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTDSPL2Q05D32 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CTDSPL2Q05D32 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CTDSPL2Q05D32 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CTDSPL2Q05D32 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTDSPL2Q05D32 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTDSPL2Q05D32 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CTDSPL2Q05D32 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms