Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHRNB3Q05901 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms