Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MDM2Q00987 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms