Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDC42EP1Q00587 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDC42EP1Q00587 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDC42EP1Q00587 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDC42EP1Q00587 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDC42EP1Q00587 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDC42EP1Q00587 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDC42EP1Q00587 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDC42EP1Q00587 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDC42EP1Q00587 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CDC42EP1Q00587 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDC42EP1Q00587 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDC42EP1Q00587 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDC42EP1Q00587 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDC42EP1Q00587 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CDC42EP1Q00587 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDC42EP1Q00587 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDC42EP1Q00587 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDC42EP1Q00587 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDC42EP1Q00587 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDC42EP1Q00587 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDC42EP1Q00587 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDC42EP1Q00587 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDC42EP1Q00587 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDC42EP1Q00587 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDC42EP1Q00587 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDC42EP1Q00587 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDC42EP1Q00587 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDC42EP1Q00587 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDC42EP1Q00587 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDC42EP1Q00587 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CDC42EP1Q00587 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDC42EP1Q00587 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDC42EP1Q00587 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDC42EP1Q00587 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDC42EP1Q00587 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDC42EP1Q00587 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDC42EP1Q00587 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDC42EP1Q00587 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDC42EP1Q00587 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDC42EP1Q00587 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDC42EP1Q00587 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDC42EP1Q00587 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDC42EP1Q00587 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDC42EP1Q00587 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDC42EP1Q00587 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDC42EP1Q00587 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDC42EP1Q00587 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDC42EP1Q00587 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDC42EP1Q00587 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDC42EP1Q00587 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CDC42EP1Q00587 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CDC42EP1Q00587 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDC42EP1Q00587 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDC42EP1Q00587 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDC42EP1Q00587 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDC42EP1Q00587 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDC42EP1Q00587 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDC42EP1Q00587 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDC42EP1Q00587 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDC42EP1Q00587 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDC42EP1Q00587 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDC42EP1Q00587 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDC42EP1Q00587 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDC42EP1Q00587 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDC42EP1Q00587 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDC42EP1Q00587 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDC42EP1Q00587 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDC42EP1Q00587 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDC42EP1Q00587 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDC42EP1Q00587 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDC42EP1Q00587 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDC42EP1Q00587 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDC42EP1Q00587 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDC42EP1Q00587 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDC42EP1Q00587 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDC42EP1Q00587 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDC42EP1Q00587 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDC42EP1Q00587 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDC42EP1Q00587 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDC42EP1Q00587 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CDC42EP1Q00587 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CDC42EP1Q00587 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDC42EP1Q00587 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDC42EP1Q00587 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDC42EP1Q00587 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDC42EP1Q00587 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDC42EP1Q00587 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDC42EP1Q00587 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDC42EP1Q00587 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDC42EP1Q00587 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDC42EP1Q00587 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDC42EP1Q00587 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDC42EP1Q00587 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDC42EP1Q00587 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDC42EP1Q00587 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDC42EP1Q00587 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDC42EP1Q00587 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDC42EP1Q00587 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDC42EP1Q00587 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms