Protein–RNA interactions for Protein: Q00537

CDK17, Cyclin-dependent kinase 17, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK17Q00537 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK17Q00537 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms