Protein–RNA interactions for Protein: Q00169

PITPNA, Phosphatidylinositol transfer protein alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNAQ00169 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PITPNAQ00169 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms