Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP2C1P98194 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP2C1P98194 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP2C1P98194 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP2C1P98194 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP2C1P98194 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP2C1P98194 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP2C1P98194 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP2C1P98194 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP2C1P98194 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP2C1P98194 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP2C1P98194 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP2C1P98194 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP2C1P98194 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP2C1P98194 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP2C1P98194 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP2C1P98194 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP2C1P98194 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP2C1P98194 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP2C1P98194 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP2C1P98194 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP2C1P98194 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP2C1P98194 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP2C1P98194 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP2C1P98194 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP2C1P98194 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP2C1P98194 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP2C1P98194 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP2C1P98194 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP2C1P98194 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP2C1P98194 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP2C1P98194 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP2C1P98194 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP2C1P98194 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP2C1P98194 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP2C1P98194 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP2C1P98194 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP2C1P98194 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP2C1P98194 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP2C1P98194 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP2C1P98194 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP2C1P98194 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP2C1P98194 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP2C1P98194 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP2C1P98194 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP2C1P98194 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP2C1P98194 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP2C1P98194 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP2C1P98194 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP2C1P98194 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP2C1P98194 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP2C1P98194 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP2C1P98194 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATP2C1P98194 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATP2C1P98194 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATP2C1P98194 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATP2C1P98194 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATP2C1P98194 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATP2C1P98194 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATP2C1P98194 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATP2C1P98194 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATP2C1P98194 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATP2C1P98194 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATP2C1P98194 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATP2C1P98194 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATP2C1P98194 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ATP2C1P98194 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATP2C1P98194 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATP2C1P98194 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATP2C1P98194 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATP2C1P98194 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATP2C1P98194 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATP2C1P98194 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATP2C1P98194 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATP2C1P98194 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATP2C1P98194 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATP2C1P98194 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATP2C1P98194 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ATP2C1P98194 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.95
ATP2C1P98194 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
ATP2C1P98194 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATP2C1P98194 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATP2C1P98194 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATP2C1P98194 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATP2C1P98194 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATP2C1P98194 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATP2C1P98194 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ATP2C1P98194 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATP2C1P98194 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATP2C1P98194 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATP2C1P98194 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATP2C1P98194 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATP2C1P98194 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATP2C1P98194 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATP2C1P98194 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATP2C1P98194 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATP2C1P98194 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ATP2C1P98194 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATP2C1P98194 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATP2C1P98194 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms