Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CBX1P83916 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CBX1P83916 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CBX1P83916 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CBX1P83916 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CBX1P83916 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CBX1P83916 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CBX1P83916 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CBX1P83916 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CBX1P83916 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CBX1P83916 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CBX1P83916 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CBX1P83916 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CBX1P83916 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CBX1P83916 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CBX1P83916 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CBX1P83916 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CBX1P83916 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CBX1P83916 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CBX1P83916 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CBX1P83916 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CBX1P83916 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CBX1P83916 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CBX1P83916 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CBX1P83916 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CBX1P83916 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CBX1P83916 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CBX1P83916 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CBX1P83916 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CBX1P83916 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CBX1P83916 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CBX1P83916 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CBX1P83916 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CBX1P83916 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CBX1P83916 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CBX1P83916 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CBX1P83916 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CBX1P83916 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CBX1P83916 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CBX1P83916 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CBX1P83916 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CBX1P83916 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CBX1P83916 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CBX1P83916 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CBX1P83916 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CBX1P83916 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CBX1P83916 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CBX1P83916 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CBX1P83916 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CBX1P83916 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CBX1P83916 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CBX1P83916 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CBX1P83916 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CBX1P83916 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CBX1P83916 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CBX1P83916 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CBX1P83916 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CBX1P83916 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CBX1P83916 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CBX1P83916 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CBX1P83916 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CBX1P83916 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CBX1P83916 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CBX1P83916 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CBX1P83916 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CBX1P83916 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CBX1P83916 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CBX1P83916 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CBX1P83916 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CBX1P83916 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CBX1P83916 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CBX1P83916 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CBX1P83916 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CBX1P83916 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CBX1P83916 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CBX1P83916 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CBX1P83916 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CBX1P83916 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CBX1P83916 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CBX1P83916 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CBX1P83916 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CBX1P83916 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CBX1P83916 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CBX1P83916 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CBX1P83916 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CBX1P83916 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CBX1P83916 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CBX1P83916 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CBX1P83916 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CBX1P83916 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CBX1P83916 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CBX1P83916 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CBX1P83916 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CBX1P83916 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CBX1P83916 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CBX1P83916 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CBX1P83916 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CBX1P83916 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CBX1P83916 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CBX1P83916 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms