Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SNRPNP63162 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms