Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HERVK_113P63121 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HERVK_113P63121 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms