Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPS29P62273 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPS29P62273 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPS29P62273 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPS29P62273 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPS29P62273 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPS29P62273 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPS29P62273 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPS29P62273 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
RPS29P62273 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPS29P62273 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPS29P62273 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPS29P62273 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPS29P62273 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
RPS29P62273 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPS29P62273 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPS29P62273 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPS29P62273 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPS29P62273 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPS29P62273 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPS29P62273 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPS29P62273 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPS29P62273 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPS29P62273 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPS29P62273 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
RPS29P62273 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPS29P62273 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPS29P62273 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPS29P62273 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
RPS29P62273 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPS29P62273 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPS29P62273 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPS29P62273 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPS29P62273 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPS29P62273 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPS29P62273 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPS29P62273 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPS29P62273 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPS29P62273 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RPS29P62273 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
RPS29P62273 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RPS29P62273 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RPS29P62273 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RPS29P62273 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RPS29P62273 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RPS29P62273 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RPS29P62273 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RPS29P62273 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RPS29P62273 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RPS29P62273 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RPS29P62273 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RPS29P62273 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RPS29P62273 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RPS29P62273 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RPS29P62273 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RPS29P62273 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
RPS29P62273 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RPS29P62273 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RPS29P62273 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RPS29P62273 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RPS29P62273 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RPS29P62273 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RPS29P62273 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RPS29P62273 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RPS29P62273 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
RPS29P62273 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
RPS29P62273 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RPS29P62273 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RPS29P62273 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RPS29P62273 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RPS29P62273 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RPS29P62273 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RPS29P62273 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RPS29P62273 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RPS29P62273 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RPS29P62273 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RPS29P62273 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RPS29P62273 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RPS29P62273 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RPS29P62273 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RPS29P62273 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RPS29P62273 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RPS29P62273 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RPS29P62273 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RPS29P62273 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RPS29P62273 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RPS29P62273 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RPS29P62273 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RPS29P62273 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RPS29P62273 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RPS29P62273 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RPS29P62273 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
RPS29P62273 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
RPS29P62273 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
RPS29P62273 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RPS29P62273 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
RPS29P62273 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RPS29P62273 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RPS29P62273 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
RPS29P62273 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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