Protein–RNA interactions for Protein: P61587

RND3, Rho-related GTP-binding protein RhoE, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RND3P61587 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RND3P61587 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RND3P61587 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RND3P61587 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RND3P61587 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RND3P61587 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RND3P61587 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RND3P61587 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RND3P61587 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RND3P61587 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RND3P61587 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RND3P61587 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RND3P61587 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RND3P61587 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RND3P61587 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RND3P61587 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RND3P61587 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RND3P61587 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RND3P61587 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RND3P61587 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RND3P61587 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RND3P61587 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RND3P61587 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RND3P61587 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RND3P61587 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RND3P61587 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RND3P61587 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RND3P61587 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RND3P61587 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RND3P61587 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RND3P61587 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RND3P61587 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RND3P61587 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RND3P61587 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RND3P61587 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RND3P61587 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RND3P61587 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RND3P61587 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RND3P61587 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RND3P61587 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RND3P61587 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RND3P61587 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RND3P61587 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RND3P61587 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RND3P61587 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RND3P61587 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RND3P61587 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RND3P61587 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RND3P61587 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RND3P61587 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RND3P61587 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RND3P61587 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RND3P61587 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RND3P61587 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RND3P61587 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RND3P61587 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RND3P61587 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RND3P61587 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RND3P61587 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RND3P61587 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RND3P61587 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RND3P61587 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RND3P61587 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RND3P61587 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RND3P61587 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RND3P61587 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RND3P61587 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RND3P61587 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RND3P61587 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RND3P61587 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RND3P61587 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RND3P61587 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RND3P61587 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RND3P61587 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RND3P61587 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RND3P61587 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RND3P61587 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RND3P61587 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RND3P61587 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RND3P61587 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RND3P61587 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RND3P61587 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RND3P61587 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RND3P61587 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RND3P61587 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RND3P61587 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RND3P61587 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RND3P61587 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RND3P61587 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RND3P61587 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RND3P61587 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RND3P61587 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RND3P61587 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RND3P61587 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RND3P61587 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RND3P61587 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RND3P61587 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RND3P61587 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RND3P61587 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RND3P61587 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms