Protein–RNA interactions for Protein: P58215

LOXL3, Lysyl oxidase homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL3P58215 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LOXL3P58215 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms