Protein–RNA interactions for Protein: P57055

RIPPLY3, Protein ripply3, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY3P57055 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RIPPLY3P57055 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms