Protein–RNA interactions for Protein: P56278

MTCP1, Protein p13 MTCP-1, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTCP1P56278 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MTCP1P56278 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MTCP1P56278 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms