Protein–RNA interactions for Protein: P52209

PGD, 6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGDP52209 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PGDP52209 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PGDP52209 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PGDP52209 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PGDP52209 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PGDP52209 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PGDP52209 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PGDP52209 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PGDP52209 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PGDP52209 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PGDP52209 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PGDP52209 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PGDP52209 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PGDP52209 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PGDP52209 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PGDP52209 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PGDP52209 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PGDP52209 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PGDP52209 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PGDP52209 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PGDP52209 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PGDP52209 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PGDP52209 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PGDP52209 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PGDP52209 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PGDP52209 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PGDP52209 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PGDP52209 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PGDP52209 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PGDP52209 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PGDP52209 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PGDP52209 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PGDP52209 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PGDP52209 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PGDP52209 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PGDP52209 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PGDP52209 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
PGDP52209 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PGDP52209 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PGDP52209 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PGDP52209 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PGDP52209 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PGDP52209 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PGDP52209 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PGDP52209 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PGDP52209 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PGDP52209 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PGDP52209 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PGDP52209 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PGDP52209 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PGDP52209 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PGDP52209 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PGDP52209 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PGDP52209 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PGDP52209 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PGDP52209 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PGDP52209 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PGDP52209 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PGDP52209 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PGDP52209 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PGDP52209 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PGDP52209 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PGDP52209 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PGDP52209 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PGDP52209 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PGDP52209 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PGDP52209 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PGDP52209 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PGDP52209 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PGDP52209 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PGDP52209 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PGDP52209 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PGDP52209 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PGDP52209 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PGDP52209 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PGDP52209 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PGDP52209 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PGDP52209 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PGDP52209 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PGDP52209 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PGDP52209 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PGDP52209 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PGDP52209 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PGDP52209 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PGDP52209 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PGDP52209 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PGDP52209 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PGDP52209 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PGDP52209 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PGDP52209 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PGDP52209 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PGDP52209 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PGDP52209 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PGDP52209 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PGDP52209 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PGDP52209 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PGDP52209 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PGDP52209 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PGDP52209 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PGDP52209 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms