Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DAP3P51398 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DAP3P51398 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DAP3P51398 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DAP3P51398 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DAP3P51398 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DAP3P51398 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DAP3P51398 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DAP3P51398 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DAP3P51398 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DAP3P51398 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
DAP3P51398 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DAP3P51398 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DAP3P51398 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DAP3P51398 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DAP3P51398 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DAP3P51398 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DAP3P51398 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DAP3P51398 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DAP3P51398 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DAP3P51398 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
DAP3P51398 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DAP3P51398 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DAP3P51398 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
DAP3P51398 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DAP3P51398 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DAP3P51398 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DAP3P51398 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DAP3P51398 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DAP3P51398 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DAP3P51398 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DAP3P51398 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DAP3P51398 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DAP3P51398 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DAP3P51398 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DAP3P51398 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DAP3P51398 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DAP3P51398 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DAP3P51398 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DAP3P51398 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DAP3P51398 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DAP3P51398 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DAP3P51398 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DAP3P51398 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DAP3P51398 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DAP3P51398 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DAP3P51398 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DAP3P51398 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DAP3P51398 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DAP3P51398 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DAP3P51398 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DAP3P51398 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DAP3P51398 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DAP3P51398 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DAP3P51398 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DAP3P51398 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DAP3P51398 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DAP3P51398 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DAP3P51398 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DAP3P51398 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DAP3P51398 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
DAP3P51398 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DAP3P51398 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DAP3P51398 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DAP3P51398 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DAP3P51398 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DAP3P51398 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DAP3P51398 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DAP3P51398 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DAP3P51398 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DAP3P51398 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DAP3P51398 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DAP3P51398 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DAP3P51398 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DAP3P51398 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DAP3P51398 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DAP3P51398 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DAP3P51398 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DAP3P51398 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DAP3P51398 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DAP3P51398 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DAP3P51398 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DAP3P51398 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DAP3P51398 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
DAP3P51398 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DAP3P51398 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DAP3P51398 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
DAP3P51398 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
DAP3P51398 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DAP3P51398 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DAP3P51398 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DAP3P51398 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DAP3P51398 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DAP3P51398 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DAP3P51398 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DAP3P51398 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DAP3P51398 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DAP3P51398 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DAP3P51398 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DAP3P51398 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms