Protein–RNA interactions for Protein: P50549

ETV1, ETS translocation variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV1P50549 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ETV1P50549 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ETV1P50549 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ETV1P50549 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ETV1P50549 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ETV1P50549 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ETV1P50549 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ETV1P50549 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ETV1P50549 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ETV1P50549 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ETV1P50549 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ETV1P50549 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ETV1P50549 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ETV1P50549 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ETV1P50549 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ETV1P50549 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ETV1P50549 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ETV1P50549 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ETV1P50549 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ETV1P50549 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ETV1P50549 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ETV1P50549 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ETV1P50549 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ETV1P50549 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ETV1P50549 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ETV1P50549 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ETV1P50549 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ETV1P50549 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ETV1P50549 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ETV1P50549 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ETV1P50549 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ETV1P50549 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ETV1P50549 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ETV1P50549 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ETV1P50549 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ETV1P50549 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ETV1P50549 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ETV1P50549 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ETV1P50549 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ETV1P50549 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ETV1P50549 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ETV1P50549 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ETV1P50549 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ETV1P50549 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ETV1P50549 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ETV1P50549 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ETV1P50549 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ETV1P50549 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ETV1P50549 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ETV1P50549 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ETV1P50549 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ETV1P50549 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ETV1P50549 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ETV1P50549 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ETV1P50549 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ETV1P50549 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ETV1P50549 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ETV1P50549 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ETV1P50549 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ETV1P50549 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ETV1P50549 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ETV1P50549 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ETV1P50549 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ETV1P50549 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ETV1P50549 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ETV1P50549 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ETV1P50549 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ETV1P50549 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ETV1P50549 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ETV1P50549 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ETV1P50549 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ETV1P50549 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ETV1P50549 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ETV1P50549 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ETV1P50549 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ETV1P50549 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ETV1P50549 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ETV1P50549 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ETV1P50549 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ETV1P50549 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ETV1P50549 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ETV1P50549 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ETV1P50549 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ETV1P50549 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ETV1P50549 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ETV1P50549 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ETV1P50549 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ETV1P50549 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ETV1P50549 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ETV1P50549 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ETV1P50549 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ETV1P50549 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ETV1P50549 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ETV1P50549 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ETV1P50549 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ETV1P50549 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ETV1P50549 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ETV1P50549 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ETV1P50549 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ETV1P50549 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms