Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERFP50548 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERFP50548 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERFP50548 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERFP50548 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERFP50548 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERFP50548 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERFP50548 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERFP50548 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERFP50548 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ERFP50548 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERFP50548 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERFP50548 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERFP50548 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERFP50548 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERFP50548 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERFP50548 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERFP50548 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERFP50548 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERFP50548 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ERFP50548 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERFP50548 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERFP50548 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERFP50548 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERFP50548 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERFP50548 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERFP50548 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERFP50548 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERFP50548 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERFP50548 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERFP50548 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ERFP50548 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERFP50548 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERFP50548 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERFP50548 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERFP50548 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERFP50548 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERFP50548 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERFP50548 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERFP50548 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ERFP50548 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ERFP50548 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
ERFP50548 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERFP50548 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ERFP50548 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERFP50548 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ERFP50548 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERFP50548 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ERFP50548 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ERFP50548 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
ERFP50548 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERFP50548 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
ERFP50548 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ERFP50548 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERFP50548 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERFP50548 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERFP50548 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERFP50548 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERFP50548 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ERFP50548 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ERFP50548 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ERFP50548 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERFP50548 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERFP50548 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERFP50548 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERFP50548 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERFP50548 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERFP50548 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERFP50548 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERFP50548 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERFP50548 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERFP50548 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERFP50548 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERFP50548 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERFP50548 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERFP50548 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ERFP50548 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERFP50548 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERFP50548 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERFP50548 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERFP50548 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERFP50548 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERFP50548 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERFP50548 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERFP50548 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERFP50548 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERFP50548 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERFP50548 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERFP50548 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERFP50548 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERFP50548 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERFP50548 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERFP50548 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ERFP50548 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERFP50548 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERFP50548 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERFP50548 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERFP50548 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERFP50548 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERFP50548 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms