Protein–RNA interactions for Protein: P49674

CSNK1E, Casein kinase I isoform epsilon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1EP49674 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CSNK1EP49674 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms