Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CASP4P49662 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CASP4P49662 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CASP4P49662 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CASP4P49662 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CASP4P49662 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CASP4P49662 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CASP4P49662 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CASP4P49662 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CASP4P49662 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CASP4P49662 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CASP4P49662 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CASP4P49662 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CASP4P49662 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CASP4P49662 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CASP4P49662 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
CASP4P49662 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CASP4P49662 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CASP4P49662 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CASP4P49662 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CASP4P49662 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CASP4P49662 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CASP4P49662 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CASP4P49662 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CASP4P49662 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CASP4P49662 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CASP4P49662 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CASP4P49662 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CASP4P49662 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CASP4P49662 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CASP4P49662 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CASP4P49662 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CASP4P49662 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CASP4P49662 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CASP4P49662 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CASP4P49662 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CASP4P49662 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CASP4P49662 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CASP4P49662 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CASP4P49662 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CASP4P49662 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CASP4P49662 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CASP4P49662 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CASP4P49662 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CASP4P49662 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CASP4P49662 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASP4P49662 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASP4P49662 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASP4P49662 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASP4P49662 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASP4P49662 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASP4P49662 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASP4P49662 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASP4P49662 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASP4P49662 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASP4P49662 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASP4P49662 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASP4P49662 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASP4P49662 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASP4P49662 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASP4P49662 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASP4P49662 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CASP4P49662 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASP4P49662 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASP4P49662 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASP4P49662 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASP4P49662 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASP4P49662 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASP4P49662 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASP4P49662 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASP4P49662 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CASP4P49662 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASP4P49662 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASP4P49662 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASP4P49662 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASP4P49662 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASP4P49662 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CASP4P49662 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASP4P49662 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASP4P49662 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASP4P49662 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASP4P49662 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASP4P49662 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASP4P49662 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASP4P49662 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASP4P49662 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CASP4P49662 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CASP4P49662 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CASP4P49662 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CASP4P49662 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CASP4P49662 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CASP4P49662 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CASP4P49662 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CASP4P49662 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CASP4P49662 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CASP4P49662 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CASP4P49662 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CASP4P49662 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CASP4P49662 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CASP4P49662 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms