Protein–RNA interactions for Protein: P49639

HOXA1, Homeobox protein Hox-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA1P49639 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXA1P49639 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXA1P49639 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXA1P49639 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXA1P49639 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXA1P49639 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXA1P49639 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXA1P49639 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXA1P49639 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXA1P49639 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXA1P49639 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXA1P49639 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXA1P49639 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXA1P49639 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXA1P49639 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXA1P49639 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXA1P49639 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXA1P49639 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXA1P49639 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXA1P49639 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXA1P49639 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXA1P49639 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXA1P49639 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXA1P49639 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXA1P49639 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXA1P49639 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXA1P49639 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXA1P49639 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXA1P49639 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXA1P49639 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXA1P49639 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXA1P49639 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXA1P49639 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXA1P49639 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXA1P49639 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXA1P49639 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXA1P49639 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXA1P49639 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXA1P49639 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXA1P49639 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXA1P49639 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXA1P49639 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXA1P49639 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXA1P49639 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXA1P49639 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXA1P49639 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXA1P49639 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXA1P49639 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXA1P49639 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXA1P49639 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms