Protein–RNA interactions for Protein: P49023

PXN, Paxillin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXNP49023 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PXNP49023 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PXNP49023 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PXNP49023 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PXNP49023 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PXNP49023 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PXNP49023 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PXNP49023 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PXNP49023 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PXNP49023 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PXNP49023 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PXNP49023 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PXNP49023 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PXNP49023 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PXNP49023 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PXNP49023 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PXNP49023 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PXNP49023 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PXNP49023 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PXNP49023 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PXNP49023 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PXNP49023 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PXNP49023 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PXNP49023 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PXNP49023 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PXNP49023 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PXNP49023 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PXNP49023 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PXNP49023 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PXNP49023 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PXNP49023 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PXNP49023 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PXNP49023 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PXNP49023 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PXNP49023 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PXNP49023 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PXNP49023 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PXNP49023 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PXNP49023 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PXNP49023 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PXNP49023 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PXNP49023 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PXNP49023 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PXNP49023 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PXNP49023 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PXNP49023 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PXNP49023 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PXNP49023 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PXNP49023 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PXNP49023 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PXNP49023 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PXNP49023 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PXNP49023 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PXNP49023 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PXNP49023 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PXNP49023 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PXNP49023 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PXNP49023 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PXNP49023 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PXNP49023 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PXNP49023 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PXNP49023 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PXNP49023 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PXNP49023 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PXNP49023 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PXNP49023 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PXNP49023 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PXNP49023 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PXNP49023 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PXNP49023 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PXNP49023 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PXNP49023 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PXNP49023 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PXNP49023 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PXNP49023 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PXNP49023 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PXNP49023 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PXNP49023 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PXNP49023 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PXNP49023 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PXNP49023 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PXNP49023 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PXNP49023 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PXNP49023 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PXNP49023 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PXNP49023 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PXNP49023 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PXNP49023 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PXNP49023 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PXNP49023 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PXNP49023 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PXNP49023 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PXNP49023 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PXNP49023 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PXNP49023 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PXNP49023 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PXNP49023 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PXNP49023 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PXNP49023 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PXNP49023 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms