Protein–RNA interactions for Protein: P48651

PTDSS1, Phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1P48651 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTDSS1P48651 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTDSS1P48651 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTDSS1P48651 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTDSS1P48651 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTDSS1P48651 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PTDSS1P48651 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PTDSS1P48651 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTDSS1P48651 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTDSS1P48651 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTDSS1P48651 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTDSS1P48651 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTDSS1P48651 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTDSS1P48651 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTDSS1P48651 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTDSS1P48651 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTDSS1P48651 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTDSS1P48651 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTDSS1P48651 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTDSS1P48651 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTDSS1P48651 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTDSS1P48651 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTDSS1P48651 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTDSS1P48651 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PTDSS1P48651 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTDSS1P48651 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTDSS1P48651 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PTDSS1P48651 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTDSS1P48651 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTDSS1P48651 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTDSS1P48651 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PTDSS1P48651 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTDSS1P48651 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTDSS1P48651 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTDSS1P48651 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTDSS1P48651 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTDSS1P48651 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTDSS1P48651 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTDSS1P48651 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTDSS1P48651 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTDSS1P48651 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTDSS1P48651 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTDSS1P48651 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTDSS1P48651 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTDSS1P48651 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTDSS1P48651 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTDSS1P48651 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTDSS1P48651 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTDSS1P48651 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTDSS1P48651 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTDSS1P48651 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTDSS1P48651 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTDSS1P48651 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PTDSS1P48651 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTDSS1P48651 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTDSS1P48651 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTDSS1P48651 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTDSS1P48651 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTDSS1P48651 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTDSS1P48651 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTDSS1P48651 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTDSS1P48651 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTDSS1P48651 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTDSS1P48651 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTDSS1P48651 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
PTDSS1P48651 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PTDSS1P48651 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
PTDSS1P48651 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
PTDSS1P48651 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTDSS1P48651 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTDSS1P48651 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTDSS1P48651 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTDSS1P48651 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTDSS1P48651 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTDSS1P48651 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTDSS1P48651 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTDSS1P48651 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTDSS1P48651 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTDSS1P48651 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTDSS1P48651 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTDSS1P48651 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTDSS1P48651 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTDSS1P48651 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTDSS1P48651 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTDSS1P48651 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTDSS1P48651 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTDSS1P48651 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTDSS1P48651 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTDSS1P48651 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTDSS1P48651 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTDSS1P48651 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTDSS1P48651 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTDSS1P48651 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PTDSS1P48651 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTDSS1P48651 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTDSS1P48651 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTDSS1P48651 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTDSS1P48651 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTDSS1P48651 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTDSS1P48651 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms