Protein–RNA interactions for Protein: P47756

CAPZB, F-actin-capping protein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZBP47756 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms