Protein–RNA interactions for Protein: P43116

PTGER2, Prostaglandin E2 receptor EP2 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER2P43116 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTGER2P43116 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTGER2P43116 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTGER2P43116 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTGER2P43116 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTGER2P43116 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTGER2P43116 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTGER2P43116 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PTGER2P43116 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTGER2P43116 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTGER2P43116 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTGER2P43116 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTGER2P43116 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTGER2P43116 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTGER2P43116 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTGER2P43116 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTGER2P43116 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTGER2P43116 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTGER2P43116 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTGER2P43116 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTGER2P43116 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTGER2P43116 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTGER2P43116 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTGER2P43116 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PTGER2P43116 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTGER2P43116 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTGER2P43116 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTGER2P43116 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTGER2P43116 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTGER2P43116 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTGER2P43116 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTGER2P43116 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTGER2P43116 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTGER2P43116 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTGER2P43116 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTGER2P43116 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTGER2P43116 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTGER2P43116 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTGER2P43116 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTGER2P43116 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTGER2P43116 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTGER2P43116 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTGER2P43116 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTGER2P43116 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTGER2P43116 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTGER2P43116 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTGER2P43116 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTGER2P43116 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTGER2P43116 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTGER2P43116 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTGER2P43116 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PTGER2P43116 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTGER2P43116 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTGER2P43116 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTGER2P43116 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTGER2P43116 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTGER2P43116 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTGER2P43116 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTGER2P43116 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTGER2P43116 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTGER2P43116 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTGER2P43116 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTGER2P43116 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTGER2P43116 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTGER2P43116 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTGER2P43116 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTGER2P43116 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTGER2P43116 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTGER2P43116 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTGER2P43116 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PTGER2P43116 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTGER2P43116 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PTGER2P43116 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTGER2P43116 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTGER2P43116 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
PTGER2P43116 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTGER2P43116 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTGER2P43116 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTGER2P43116 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTGER2P43116 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTGER2P43116 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTGER2P43116 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTGER2P43116 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTGER2P43116 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTGER2P43116 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PTGER2P43116 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTGER2P43116 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTGER2P43116 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTGER2P43116 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTGER2P43116 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTGER2P43116 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTGER2P43116 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTGER2P43116 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTGER2P43116 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTGER2P43116 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTGER2P43116 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTGER2P43116 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTGER2P43116 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTGER2P43116 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTGER2P43116 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms