Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMPOP42166 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMPOP42166 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMPOP42166 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMPOP42166 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMPOP42166 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMPOP42166 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMPOP42166 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMPOP42166 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMPOP42166 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMPOP42166 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMPOP42166 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TMPOP42166 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMPOP42166 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMPOP42166 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMPOP42166 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMPOP42166 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMPOP42166 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMPOP42166 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TMPOP42166 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TMPOP42166 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TMPOP42166 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMPOP42166 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMPOP42166 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMPOP42166 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMPOP42166 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMPOP42166 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMPOP42166 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMPOP42166 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMPOP42166 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMPOP42166 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TMPOP42166 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMPOP42166 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMPOP42166 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMPOP42166 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMPOP42166 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMPOP42166 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TMPOP42166 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMPOP42166 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMPOP42166 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMPOP42166 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TMPOP42166 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMPOP42166 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMPOP42166 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMPOP42166 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMPOP42166 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMPOP42166 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMPOP42166 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMPOP42166 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMPOP42166 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMPOP42166 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMPOP42166 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMPOP42166 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMPOP42166 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMPOP42166 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMPOP42166 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMPOP42166 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TMPOP42166 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMPOP42166 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TMPOP42166 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMPOP42166 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMPOP42166 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMPOP42166 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMPOP42166 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMPOP42166 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TMPOP42166 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TMPOP42166 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TMPOP42166 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TMPOP42166 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMPOP42166 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMPOP42166 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMPOP42166 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMPOP42166 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMPOP42166 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMPOP42166 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMPOP42166 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMPOP42166 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMPOP42166 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMPOP42166 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TMPOP42166 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMPOP42166 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMPOP42166 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMPOP42166 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMPOP42166 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMPOP42166 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMPOP42166 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMPOP42166 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMPOP42166 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMPOP42166 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMPOP42166 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMPOP42166 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMPOP42166 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMPOP42166 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMPOP42166 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TMPOP42166 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMPOP42166 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMPOP42166 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMPOP42166 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMPOP42166 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMPOP42166 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms