Protein–RNA interactions for Protein: P42025

ACTR1B, Beta-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1BP42025 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTR1BP42025 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ACTR1BP42025 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms