Protein–RNA interactions for Protein: P41229

KDM5C, Lysine-specific demethylase 5C, humanhuman

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5CP41229 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
KDM5CP41229 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
KDM5CP41229 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
KDM5CP41229 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
KDM5CP41229 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
KDM5CP41229 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
KDM5CP41229 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
KDM5CP41229 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
KDM5CP41229 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
KDM5CP41229 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
KDM5CP41229 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
KDM5CP41229 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
KDM5CP41229 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
KDM5CP41229 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
KDM5CP41229 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
KDM5CP41229 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
KDM5CP41229 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
KDM5CP41229 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
KDM5CP41229 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
KDM5CP41229 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
KDM5CP41229 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
KDM5CP41229 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
KDM5CP41229 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
KDM5CP41229 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
KDM5CP41229 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KDM5CP41229 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KDM5CP41229 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KDM5CP41229 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KDM5CP41229 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KDM5CP41229 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KDM5CP41229 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KDM5CP41229 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KDM5CP41229 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KDM5CP41229 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KDM5CP41229 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KDM5CP41229 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KDM5CP41229 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KDM5CP41229 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KDM5CP41229 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KDM5CP41229 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KDM5CP41229 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KDM5CP41229 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KDM5CP41229 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KDM5CP41229 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KDM5CP41229 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KDM5CP41229 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KDM5CP41229 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KDM5CP41229 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KDM5CP41229 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KDM5CP41229 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
KDM5CP41229 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KDM5CP41229 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
KDM5CP41229 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KDM5CP41229 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KDM5CP41229 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KDM5CP41229 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KDM5CP41229 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KDM5CP41229 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KDM5CP41229 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KDM5CP41229 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KDM5CP41229 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KDM5CP41229 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KDM5CP41229 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
KDM5CP41229 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
KDM5CP41229 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
KDM5CP41229 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KDM5CP41229 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KDM5CP41229 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
KDM5CP41229 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KDM5CP41229 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
KDM5CP41229 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KDM5CP41229 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KDM5CP41229 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KDM5CP41229 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
KDM5CP41229 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
KDM5CP41229 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
KDM5CP41229 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KDM5CP41229 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
KDM5CP41229 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KDM5CP41229 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
KDM5CP41229 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
KDM5CP41229 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
KDM5CP41229 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
KDM5CP41229 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KDM5CP41229 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
KDM5CP41229 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
KDM5CP41229 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
KDM5CP41229 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KDM5CP41229 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KDM5CP41229 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KDM5CP41229 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KDM5CP41229 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KDM5CP41229 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KDM5CP41229 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
KDM5CP41229 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
KDM5CP41229 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KDM5CP41229 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KDM5CP41229 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KDM5CP41229 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KDM5CP41229 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms