Protein–RNA interactions for Protein: P37840

SNCA, Alpha-synuclein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCAP37840 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNCAP37840 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNCAP37840 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNCAP37840 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNCAP37840 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNCAP37840 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNCAP37840 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SNCAP37840 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNCAP37840 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNCAP37840 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNCAP37840 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNCAP37840 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SNCAP37840 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNCAP37840 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNCAP37840 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNCAP37840 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNCAP37840 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNCAP37840 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNCAP37840 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNCAP37840 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNCAP37840 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNCAP37840 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNCAP37840 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNCAP37840 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNCAP37840 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNCAP37840 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNCAP37840 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNCAP37840 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNCAP37840 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNCAP37840 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNCAP37840 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNCAP37840 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SNCAP37840 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNCAP37840 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNCAP37840 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNCAP37840 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNCAP37840 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNCAP37840 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNCAP37840 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNCAP37840 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNCAP37840 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNCAP37840 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNCAP37840 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SNCAP37840 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNCAP37840 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNCAP37840 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNCAP37840 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNCAP37840 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNCAP37840 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNCAP37840 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNCAP37840 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNCAP37840 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNCAP37840 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNCAP37840 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNCAP37840 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SNCAP37840 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNCAP37840 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNCAP37840 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNCAP37840 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNCAP37840 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SNCAP37840 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNCAP37840 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNCAP37840 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNCAP37840 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNCAP37840 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNCAP37840 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNCAP37840 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNCAP37840 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNCAP37840 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNCAP37840 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNCAP37840 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNCAP37840 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SNCAP37840 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNCAP37840 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNCAP37840 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
SNCAP37840 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNCAP37840 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNCAP37840 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNCAP37840 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNCAP37840 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNCAP37840 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNCAP37840 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNCAP37840 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
SNCAP37840 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNCAP37840 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNCAP37840 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNCAP37840 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNCAP37840 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNCAP37840 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNCAP37840 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SNCAP37840 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SNCAP37840 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNCAP37840 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNCAP37840 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNCAP37840 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SNCAP37840 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNCAP37840 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SNCAP37840 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNCAP37840 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNCAP37840 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms