Protein–RNA interactions for Protein: P37198

NUP62, Nuclear pore glycoprotein p62, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP62P37198 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NUP62P37198 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NUP62P37198 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NUP62P37198 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NUP62P37198 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NUP62P37198 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NUP62P37198 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NUP62P37198 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NUP62P37198 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NUP62P37198 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NUP62P37198 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NUP62P37198 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP62P37198 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP62P37198 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP62P37198 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP62P37198 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP62P37198 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP62P37198 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP62P37198 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP62P37198 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP62P37198 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP62P37198 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP62P37198 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP62P37198 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP62P37198 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP62P37198 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP62P37198 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP62P37198 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP62P37198 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP62P37198 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP62P37198 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP62P37198 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP62P37198 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP62P37198 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP62P37198 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP62P37198 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP62P37198 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP62P37198 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP62P37198 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP62P37198 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP62P37198 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP62P37198 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP62P37198 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP62P37198 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP62P37198 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP62P37198 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP62P37198 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP62P37198 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP62P37198 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP62P37198 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NUP62P37198 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP62P37198 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP62P37198 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP62P37198 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP62P37198 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP62P37198 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP62P37198 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP62P37198 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP62P37198 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP62P37198 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP62P37198 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP62P37198 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP62P37198 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP62P37198 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP62P37198 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP62P37198 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP62P37198 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP62P37198 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP62P37198 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP62P37198 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP62P37198 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP62P37198 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP62P37198 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP62P37198 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP62P37198 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP62P37198 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP62P37198 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP62P37198 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP62P37198 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP62P37198 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP62P37198 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP62P37198 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP62P37198 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP62P37198 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP62P37198 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP62P37198 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP62P37198 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP62P37198 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP62P37198 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NUP62P37198 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NUP62P37198 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NUP62P37198 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NUP62P37198 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NUP62P37198 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NUP62P37198 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NUP62P37198 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NUP62P37198 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NUP62P37198 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NUP62P37198 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NUP62P37198 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms