Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
HOXA13P31271 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXA13P31271 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXA13P31271 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXA13P31271 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXA13P31271 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXA13P31271 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXA13P31271 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXA13P31271 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXA13P31271 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXA13P31271 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXA13P31271 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXA13P31271 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXA13P31271 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXA13P31271 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXA13P31271 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXA13P31271 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXA13P31271 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXA13P31271 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXA13P31271 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXA13P31271 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms