Protein–RNA interactions for Protein: P30260

CDC27, Cell division cycle protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC27P30260 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDC27P30260 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDC27P30260 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDC27P30260 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDC27P30260 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDC27P30260 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDC27P30260 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDC27P30260 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDC27P30260 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDC27P30260 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDC27P30260 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDC27P30260 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDC27P30260 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDC27P30260 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDC27P30260 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDC27P30260 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDC27P30260 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CDC27P30260 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDC27P30260 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDC27P30260 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDC27P30260 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDC27P30260 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDC27P30260 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDC27P30260 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDC27P30260 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDC27P30260 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDC27P30260 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CDC27P30260 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDC27P30260 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDC27P30260 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDC27P30260 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDC27P30260 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDC27P30260 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDC27P30260 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDC27P30260 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDC27P30260 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CDC27P30260 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDC27P30260 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDC27P30260 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CDC27P30260 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDC27P30260 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDC27P30260 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDC27P30260 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDC27P30260 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDC27P30260 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CDC27P30260 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDC27P30260 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDC27P30260 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDC27P30260 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDC27P30260 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDC27P30260 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDC27P30260 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDC27P30260 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDC27P30260 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDC27P30260 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDC27P30260 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDC27P30260 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDC27P30260 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDC27P30260 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CDC27P30260 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDC27P30260 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDC27P30260 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDC27P30260 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDC27P30260 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDC27P30260 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CDC27P30260 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDC27P30260 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDC27P30260 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CDC27P30260 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CDC27P30260 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDC27P30260 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDC27P30260 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDC27P30260 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDC27P30260 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDC27P30260 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDC27P30260 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDC27P30260 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDC27P30260 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CDC27P30260 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDC27P30260 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDC27P30260 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDC27P30260 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDC27P30260 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDC27P30260 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDC27P30260 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDC27P30260 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDC27P30260 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDC27P30260 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDC27P30260 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDC27P30260 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDC27P30260 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDC27P30260 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDC27P30260 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDC27P30260 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDC27P30260 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDC27P30260 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDC27P30260 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CDC27P30260 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDC27P30260 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDC27P30260 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms