Protein–RNA interactions for Protein: P30085

CMPK1, UMP-CMP kinase, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK1P30085 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CMPK1P30085 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CMPK1P30085 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CMPK1P30085 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CMPK1P30085 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CMPK1P30085 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CMPK1P30085 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CMPK1P30085 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CMPK1P30085 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CMPK1P30085 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CMPK1P30085 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CMPK1P30085 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CMPK1P30085 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CMPK1P30085 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CMPK1P30085 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CMPK1P30085 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CMPK1P30085 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CMPK1P30085 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CMPK1P30085 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CMPK1P30085 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CMPK1P30085 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CMPK1P30085 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CMPK1P30085 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CMPK1P30085 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CMPK1P30085 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CMPK1P30085 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CMPK1P30085 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CMPK1P30085 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CMPK1P30085 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CMPK1P30085 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CMPK1P30085 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CMPK1P30085 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CMPK1P30085 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CMPK1P30085 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CMPK1P30085 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CMPK1P30085 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CMPK1P30085 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CMPK1P30085 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CMPK1P30085 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CMPK1P30085 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CMPK1P30085 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CMPK1P30085 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CMPK1P30085 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CMPK1P30085 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CMPK1P30085 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CMPK1P30085 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CMPK1P30085 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CMPK1P30085 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CMPK1P30085 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CMPK1P30085 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CMPK1P30085 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CMPK1P30085 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CMPK1P30085 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CMPK1P30085 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CMPK1P30085 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CMPK1P30085 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CMPK1P30085 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CMPK1P30085 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CMPK1P30085 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CMPK1P30085 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CMPK1P30085 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CMPK1P30085 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CMPK1P30085 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CMPK1P30085 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CMPK1P30085 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CMPK1P30085 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CMPK1P30085 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CMPK1P30085 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CMPK1P30085 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CMPK1P30085 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CMPK1P30085 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CMPK1P30085 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CMPK1P30085 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CMPK1P30085 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CMPK1P30085 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CMPK1P30085 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CMPK1P30085 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CMPK1P30085 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CMPK1P30085 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CMPK1P30085 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CMPK1P30085 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CMPK1P30085 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CMPK1P30085 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CMPK1P30085 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CMPK1P30085 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CMPK1P30085 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CMPK1P30085 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CMPK1P30085 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CMPK1P30085 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CMPK1P30085 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CMPK1P30085 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CMPK1P30085 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CMPK1P30085 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CMPK1P30085 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CMPK1P30085 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CMPK1P30085 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CMPK1P30085 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CMPK1P30085 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CMPK1P30085 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CMPK1P30085 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms