Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CASP1P29466 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CASP1P29466 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CASP1P29466 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CASP1P29466 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CASP1P29466 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CASP1P29466 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CASP1P29466 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CASP1P29466 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CASP1P29466 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CASP1P29466 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CASP1P29466 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CASP1P29466 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CASP1P29466 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CASP1P29466 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CASP1P29466 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CASP1P29466 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CASP1P29466 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CASP1P29466 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CASP1P29466 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CASP1P29466 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CASP1P29466 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CASP1P29466 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CASP1P29466 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CASP1P29466 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CASP1P29466 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CASP1P29466 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CASP1P29466 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CASP1P29466 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CASP1P29466 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CASP1P29466 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CASP1P29466 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CASP1P29466 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CASP1P29466 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CASP1P29466 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CASP1P29466 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CASP1P29466 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CASP1P29466 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CASP1P29466 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CASP1P29466 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CASP1P29466 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CASP1P29466 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CASP1P29466 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CASP1P29466 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CASP1P29466 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CASP1P29466 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CASP1P29466 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CASP1P29466 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CASP1P29466 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CASP1P29466 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CASP1P29466 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CASP1P29466 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CASP1P29466 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CASP1P29466 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CASP1P29466 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CASP1P29466 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CASP1P29466 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CASP1P29466 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CASP1P29466 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CASP1P29466 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CASP1P29466 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CASP1P29466 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CASP1P29466 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CASP1P29466 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CASP1P29466 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CASP1P29466 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CASP1P29466 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CASP1P29466 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CASP1P29466 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CASP1P29466 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CASP1P29466 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CASP1P29466 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CASP1P29466 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CASP1P29466 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CASP1P29466 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CASP1P29466 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CASP1P29466 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CASP1P29466 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CASP1P29466 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CASP1P29466 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CASP1P29466 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CASP1P29466 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CASP1P29466 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CASP1P29466 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CASP1P29466 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CASP1P29466 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CASP1P29466 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CASP1P29466 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CASP1P29466 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CASP1P29466 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CASP1P29466 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CASP1P29466 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CASP1P29466 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CASP1P29466 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CASP1P29466 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CASP1P29466 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CASP1P29466 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CASP1P29466 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CASP1P29466 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CASP1P29466 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms