Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXD10P28358 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXD10P28358 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXD10P28358 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXD10P28358 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXD10P28358 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXD10P28358 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXD10P28358 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXD10P28358 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXD10P28358 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXD10P28358 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXD10P28358 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXD10P28358 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXD10P28358 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXD10P28358 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXD10P28358 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXD10P28358 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXD10P28358 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXD10P28358 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXD10P28358 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXD10P28358 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXD10P28358 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXD10P28358 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXD10P28358 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXD10P28358 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXD10P28358 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXD10P28358 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXD10P28358 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXD10P28358 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXD10P28358 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXD10P28358 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXD10P28358 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXD10P28358 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXD10P28358 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXD10P28358 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXD10P28358 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXD10P28358 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXD10P28358 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXD10P28358 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXD10P28358 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXD10P28358 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXD10P28358 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXD10P28358 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXD10P28358 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXD10P28358 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXD10P28358 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXD10P28358 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXD10P28358 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXD10P28358 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXD10P28358 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXD10P28358 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXD10P28358 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXD10P28358 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXD10P28358 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXD10P28358 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXD10P28358 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXD10P28358 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXD10P28358 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
HOXD10P28358 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC20.95■□□□□ 0.95
HOXD10P28358 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXD10P28358 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXD10P28358 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXD10P28358 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXD10P28358 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXD10P28358 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXD10P28358 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXD10P28358 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXD10P28358 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXD10P28358 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXD10P28358 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXD10P28358 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXD10P28358 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXD10P28358 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXD10P28358 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXD10P28358 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXD10P28358 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXD10P28358 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXD10P28358 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXD10P28358 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXD10P28358 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXD10P28358 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXD10P28358 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXD10P28358 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXD10P28358 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXD10P28358 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXD10P28358 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXD10P28358 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXD10P28358 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXD10P28358 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXD10P28358 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXD10P28358 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXD10P28358 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXD10P28358 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXD10P28358 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXD10P28358 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXD10P28358 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXD10P28358 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXD10P28358 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXD10P28358 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXD10P28358 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms