Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PSMB4P28070 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms