Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PSMB9P28065 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms