Protein–RNA interactions for Protein: P26842

CD27, CD27 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD27P26842 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CD27P26842 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CD27P26842 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CD27P26842 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CD27P26842 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CD27P26842 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CD27P26842 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CD27P26842 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CD27P26842 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CD27P26842 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CD27P26842 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CD27P26842 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CD27P26842 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CD27P26842 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CD27P26842 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CD27P26842 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CD27P26842 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CD27P26842 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CD27P26842 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CD27P26842 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CD27P26842 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CD27P26842 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
CD27P26842 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CD27P26842 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CD27P26842 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CD27P26842 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD27P26842 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD27P26842 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD27P26842 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD27P26842 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD27P26842 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD27P26842 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CD27P26842 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD27P26842 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD27P26842 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CD27P26842 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CD27P26842 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD27P26842 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD27P26842 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD27P26842 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD27P26842 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD27P26842 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CD27P26842 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD27P26842 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD27P26842 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD27P26842 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD27P26842 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD27P26842 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD27P26842 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD27P26842 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CD27P26842 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD27P26842 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD27P26842 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD27P26842 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD27P26842 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD27P26842 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD27P26842 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD27P26842 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD27P26842 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD27P26842 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD27P26842 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD27P26842 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD27P26842 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD27P26842 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD27P26842 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD27P26842 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD27P26842 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD27P26842 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD27P26842 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD27P26842 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD27P26842 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD27P26842 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD27P26842 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD27P26842 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CD27P26842 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD27P26842 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD27P26842 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CD27P26842 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD27P26842 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD27P26842 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD27P26842 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD27P26842 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD27P26842 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD27P26842 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD27P26842 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CD27P26842 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD27P26842 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD27P26842 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD27P26842 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD27P26842 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD27P26842 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD27P26842 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD27P26842 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD27P26842 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD27P26842 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD27P26842 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD27P26842 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD27P26842 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD27P26842 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD27P26842 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms