Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPREP23469 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPREP23469 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPREP23469 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPREP23469 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPREP23469 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPREP23469 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPREP23469 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPREP23469 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPREP23469 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPREP23469 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPREP23469 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPREP23469 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPREP23469 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPREP23469 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPREP23469 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPREP23469 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPREP23469 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPREP23469 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPREP23469 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPREP23469 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPREP23469 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPREP23469 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPREP23469 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPREP23469 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPREP23469 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPREP23469 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPREP23469 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPREP23469 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPREP23469 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPREP23469 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPREP23469 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPREP23469 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPREP23469 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPREP23469 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPREP23469 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPREP23469 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPREP23469 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPREP23469 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPREP23469 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPREP23469 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPREP23469 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPREP23469 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPREP23469 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPREP23469 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPREP23469 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPREP23469 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPREP23469 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPREP23469 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPREP23469 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPREP23469 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPREP23469 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPREP23469 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPREP23469 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPREP23469 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPREP23469 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPREP23469 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPREP23469 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPREP23469 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPREP23469 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPREP23469 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPREP23469 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPREP23469 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPREP23469 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPREP23469 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPREP23469 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPREP23469 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPREP23469 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPREP23469 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPREP23469 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPREP23469 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPREP23469 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPREP23469 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPREP23469 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPREP23469 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPREP23469 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPREP23469 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPREP23469 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPREP23469 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPREP23469 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPREP23469 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPREP23469 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPREP23469 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPREP23469 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPREP23469 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPREP23469 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPREP23469 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPREP23469 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPREP23469 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPREP23469 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPREP23469 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPREP23469 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPREP23469 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPREP23469 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPREP23469 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPREP23469 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPREP23469 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPREP23469 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPREP23469 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPREP23469 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms