Protein–RNA interactions for Protein: P22001

KCNA3, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA3P22001 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNA3P22001 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNA3P22001 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNA3P22001 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNA3P22001 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNA3P22001 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNA3P22001 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
KCNA3P22001 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNA3P22001 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNA3P22001 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNA3P22001 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNA3P22001 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNA3P22001 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNA3P22001 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNA3P22001 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNA3P22001 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNA3P22001 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNA3P22001 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNA3P22001 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNA3P22001 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNA3P22001 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNA3P22001 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNA3P22001 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNA3P22001 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNA3P22001 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNA3P22001 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNA3P22001 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNA3P22001 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNA3P22001 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNA3P22001 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNA3P22001 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNA3P22001 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNA3P22001 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNA3P22001 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNA3P22001 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNA3P22001 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNA3P22001 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNA3P22001 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNA3P22001 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNA3P22001 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNA3P22001 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNA3P22001 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNA3P22001 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNA3P22001 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNA3P22001 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNA3P22001 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNA3P22001 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNA3P22001 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNA3P22001 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNA3P22001 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNA3P22001 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNA3P22001 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNA3P22001 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNA3P22001 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNA3P22001 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNA3P22001 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNA3P22001 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNA3P22001 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNA3P22001 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNA3P22001 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNA3P22001 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNA3P22001 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNA3P22001 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNA3P22001 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNA3P22001 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNA3P22001 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNA3P22001 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNA3P22001 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNA3P22001 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNA3P22001 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNA3P22001 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNA3P22001 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNA3P22001 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNA3P22001 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNA3P22001 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNA3P22001 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNA3P22001 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNA3P22001 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNA3P22001 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNA3P22001 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNA3P22001 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNA3P22001 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNA3P22001 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNA3P22001 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNA3P22001 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNA3P22001 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNA3P22001 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNA3P22001 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNA3P22001 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNA3P22001 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNA3P22001 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNA3P22001 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNA3P22001 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNA3P22001 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNA3P22001 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNA3P22001 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNA3P22001 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNA3P22001 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNA3P22001 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNA3P22001 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms