Protein–RNA interactions for Protein: P19338

NCL, Nucleolin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCLP19338 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCLP19338 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NCLP19338 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCLP19338 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCLP19338 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCLP19338 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCLP19338 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCLP19338 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCLP19338 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCLP19338 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NCLP19338 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NCLP19338 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCLP19338 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCLP19338 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCLP19338 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCLP19338 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCLP19338 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCLP19338 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NCLP19338 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCLP19338 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCLP19338 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCLP19338 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCLP19338 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCLP19338 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCLP19338 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCLP19338 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NCLP19338 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCLP19338 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NCLP19338 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCLP19338 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCLP19338 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCLP19338 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCLP19338 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCLP19338 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCLP19338 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCLP19338 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCLP19338 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCLP19338 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCLP19338 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCLP19338 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NCLP19338 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NCLP19338 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NCLP19338 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NCLP19338 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NCLP19338 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NCLP19338 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NCLP19338 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NCLP19338 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NCLP19338 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NCLP19338 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NCLP19338 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NCLP19338 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NCLP19338 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NCLP19338 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NCLP19338 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NCLP19338 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NCLP19338 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NCLP19338 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NCLP19338 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NCLP19338 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NCLP19338 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NCLP19338 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NCLP19338 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NCLP19338 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NCLP19338 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NCLP19338 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NCLP19338 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NCLP19338 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NCLP19338 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NCLP19338 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NCLP19338 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NCLP19338 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCLP19338 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCLP19338 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCLP19338 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCLP19338 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCLP19338 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCLP19338 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCLP19338 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCLP19338 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCLP19338 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCLP19338 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCLP19338 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCLP19338 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCLP19338 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCLP19338 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NCLP19338 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCLP19338 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCLP19338 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCLP19338 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCLP19338 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCLP19338 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCLP19338 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCLP19338 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCLP19338 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCLP19338 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCLP19338 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCLP19338 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCLP19338 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCLP19338 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms