Protein–RNA interactions for Protein: P18858

LIG1, DNA ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIG1P18858 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LIG1P18858 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LIG1P18858 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LIG1P18858 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LIG1P18858 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LIG1P18858 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LIG1P18858 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LIG1P18858 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LIG1P18858 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LIG1P18858 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LIG1P18858 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LIG1P18858 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LIG1P18858 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LIG1P18858 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LIG1P18858 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LIG1P18858 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
LIG1P18858 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LIG1P18858 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LIG1P18858 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
LIG1P18858 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LIG1P18858 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
LIG1P18858 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LIG1P18858 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LIG1P18858 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LIG1P18858 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LIG1P18858 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LIG1P18858 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LIG1P18858 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LIG1P18858 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LIG1P18858 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LIG1P18858 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LIG1P18858 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LIG1P18858 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LIG1P18858 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
LIG1P18858 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LIG1P18858 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LIG1P18858 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LIG1P18858 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LIG1P18858 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LIG1P18858 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LIG1P18858 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LIG1P18858 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LIG1P18858 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LIG1P18858 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LIG1P18858 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LIG1P18858 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LIG1P18858 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LIG1P18858 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LIG1P18858 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LIG1P18858 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LIG1P18858 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LIG1P18858 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LIG1P18858 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LIG1P18858 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LIG1P18858 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LIG1P18858 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LIG1P18858 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LIG1P18858 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LIG1P18858 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LIG1P18858 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LIG1P18858 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LIG1P18858 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LIG1P18858 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LIG1P18858 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LIG1P18858 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LIG1P18858 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
LIG1P18858 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LIG1P18858 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LIG1P18858 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
LIG1P18858 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LIG1P18858 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LIG1P18858 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LIG1P18858 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LIG1P18858 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LIG1P18858 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LIG1P18858 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LIG1P18858 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LIG1P18858 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
LIG1P18858 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LIG1P18858 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LIG1P18858 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LIG1P18858 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LIG1P18858 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LIG1P18858 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LIG1P18858 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LIG1P18858 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LIG1P18858 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
LIG1P18858 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LIG1P18858 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LIG1P18858 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LIG1P18858 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LIG1P18858 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LIG1P18858 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LIG1P18858 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LIG1P18858 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LIG1P18858 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
LIG1P18858 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
LIG1P18858 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LIG1P18858 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LIG1P18858 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms