Protein–RNA interactions for Protein: P17301

ITGA2, Integrin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA2P17301 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGA2P17301 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGA2P17301 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGA2P17301 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGA2P17301 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGA2P17301 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGA2P17301 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGA2P17301 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGA2P17301 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGA2P17301 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGA2P17301 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGA2P17301 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGA2P17301 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGA2P17301 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGA2P17301 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGA2P17301 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGA2P17301 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGA2P17301 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGA2P17301 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGA2P17301 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGA2P17301 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGA2P17301 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGA2P17301 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGA2P17301 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGA2P17301 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGA2P17301 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGA2P17301 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGA2P17301 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA2P17301 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA2P17301 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA2P17301 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA2P17301 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA2P17301 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA2P17301 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA2P17301 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA2P17301 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA2P17301 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA2P17301 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA2P17301 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA2P17301 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA2P17301 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA2P17301 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA2P17301 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA2P17301 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA2P17301 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA2P17301 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA2P17301 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA2P17301 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA2P17301 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA2P17301 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA2P17301 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA2P17301 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA2P17301 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA2P17301 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA2P17301 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA2P17301 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA2P17301 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA2P17301 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA2P17301 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA2P17301 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA2P17301 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA2P17301 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA2P17301 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA2P17301 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA2P17301 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA2P17301 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA2P17301 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA2P17301 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA2P17301 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA2P17301 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA2P17301 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA2P17301 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA2P17301 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA2P17301 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA2P17301 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA2P17301 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA2P17301 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA2P17301 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA2P17301 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA2P17301 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA2P17301 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA2P17301 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA2P17301 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA2P17301 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA2P17301 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA2P17301 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA2P17301 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA2P17301 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA2P17301 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA2P17301 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA2P17301 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA2P17301 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA2P17301 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA2P17301 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA2P17301 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA2P17301 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA2P17301 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA2P17301 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA2P17301 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA2P17301 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms