Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGB4P16144 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGB4P16144 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGB4P16144 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGB4P16144 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGB4P16144 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGB4P16144 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGB4P16144 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGB4P16144 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGB4P16144 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGB4P16144 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGB4P16144 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGB4P16144 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGB4P16144 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGB4P16144 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGB4P16144 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGB4P16144 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGB4P16144 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGB4P16144 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGB4P16144 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGB4P16144 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGB4P16144 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGB4P16144 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGB4P16144 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGB4P16144 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGB4P16144 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGB4P16144 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGB4P16144 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGB4P16144 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGB4P16144 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGB4P16144 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGB4P16144 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGB4P16144 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGB4P16144 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGB4P16144 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGB4P16144 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGB4P16144 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGB4P16144 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGB4P16144 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGB4P16144 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGB4P16144 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGB4P16144 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGB4P16144 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGB4P16144 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGB4P16144 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGB4P16144 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGB4P16144 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGB4P16144 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGB4P16144 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGB4P16144 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGB4P16144 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITGB4P16144 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITGB4P16144 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITGB4P16144 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITGB4P16144 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITGB4P16144 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITGB4P16144 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITGB4P16144 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITGB4P16144 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITGB4P16144 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITGB4P16144 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITGB4P16144 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITGB4P16144 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITGB4P16144 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITGB4P16144 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITGB4P16144 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITGB4P16144 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITGB4P16144 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ITGB4P16144 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ITGB4P16144 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ITGB4P16144 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ITGB4P16144 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ITGB4P16144 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGB4P16144 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGB4P16144 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGB4P16144 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGB4P16144 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGB4P16144 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGB4P16144 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGB4P16144 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGB4P16144 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGB4P16144 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGB4P16144 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGB4P16144 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGB4P16144 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGB4P16144 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGB4P16144 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGB4P16144 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGB4P16144 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGB4P16144 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGB4P16144 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGB4P16144 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGB4P16144 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGB4P16144 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGB4P16144 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGB4P16144 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGB4P16144 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGB4P16144 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGB4P16144 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGB4P16144 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms