Protein–RNA interactions for Protein: P13866

SLC5A1, Sodium/glucose cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A1P13866 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC5A1P13866 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC5A1P13866 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC5A1P13866 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC5A1P13866 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC5A1P13866 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC5A1P13866 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC5A1P13866 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC5A1P13866 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC5A1P13866 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC5A1P13866 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC5A1P13866 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC5A1P13866 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC5A1P13866 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC5A1P13866 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC5A1P13866 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC5A1P13866 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC5A1P13866 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC5A1P13866 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC5A1P13866 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC5A1P13866 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC5A1P13866 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC5A1P13866 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC5A1P13866 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC5A1P13866 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC5A1P13866 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC5A1P13866 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC5A1P13866 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC5A1P13866 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC5A1P13866 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC5A1P13866 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC5A1P13866 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC5A1P13866 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC5A1P13866 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC5A1P13866 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC5A1P13866 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC5A1P13866 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC5A1P13866 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC5A1P13866 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC5A1P13866 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC5A1P13866 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC5A1P13866 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC5A1P13866 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC5A1P13866 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC5A1P13866 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC5A1P13866 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC5A1P13866 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC5A1P13866 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC5A1P13866 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC5A1P13866 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC5A1P13866 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC5A1P13866 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC5A1P13866 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC5A1P13866 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC5A1P13866 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC5A1P13866 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC5A1P13866 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC5A1P13866 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC5A1P13866 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC5A1P13866 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC5A1P13866 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC5A1P13866 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC5A1P13866 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC5A1P13866 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC5A1P13866 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC5A1P13866 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC5A1P13866 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC5A1P13866 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC5A1P13866 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC5A1P13866 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC5A1P13866 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC5A1P13866 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC5A1P13866 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC5A1P13866 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC5A1P13866 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC5A1P13866 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC5A1P13866 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC5A1P13866 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC5A1P13866 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC5A1P13866 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC5A1P13866 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC5A1P13866 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC5A1P13866 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC5A1P13866 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC5A1P13866 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC5A1P13866 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC5A1P13866 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC5A1P13866 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC5A1P13866 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC5A1P13866 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC5A1P13866 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC5A1P13866 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC5A1P13866 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC5A1P13866 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC5A1P13866 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC5A1P13866 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC5A1P13866 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC5A1P13866 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC5A1P13866 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC5A1P13866 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms